Я не очень понял критерии поиска строк, которые нужно убрать. Но если нужны подобные строки, начинающиеся с Mirrored from, тогда заменяем
<!-- Mirrored from [^\n>]*?-->\r\n
на пустое место.
Если критерием является дата и время в подобном формате, то заменяем
<!-- [^\n>]*?, \d+ [A-z]+ \d{4} \d+:\d\d:\d\d GMT -->\r\n
Если же нужны любые строки с соответствующим тэгом <!-- -->, то заменяем
<!-- [^\n>]*?-->\r\n